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倒置显微镜的组成和普通光学显微镜一样，只不过物镜和照明系统颠倒，前者在载物台之下，后者在载物台之上，这样的设计是为了适应生物学、医学等领域中的组织培养、细胞离体培养、浮游生物、环境保护、食品检验等显微观察。

该故障可导致显微镜观察效果下降，具体判断方法可通过拔下目镜的向镜筒里观察，如光路有长霉或大块的污物，可被清晰的观察到，同时也可以通过转动各个光学部件来准确判断污物和霉斑的位置，如光路只是由于时间的关系积尘太多，也可以看到光路不够透亮。

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借助材料显微组织结构的计算机辅助模型化与仿真设计，运用数理统计和图像分析技术，由二维图像来推断三维组织图像的科学称为体视学，使组织图像的定量分析（定量金相学）成为材料科学与工程发展史上成功的实验技术之一，也是金相学发展的趋势。

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但放大倍数一般在200倍以下，放大率不如其他类型显微镜，倒置显微镜，因此，物镜、聚光镜和光源的位置都颠倒过来，故称为“倒置显微镜”，如果用户有特殊需要，也可以选配其它附件，用来实现微分干涉、荧光、简易偏光等观察。